基因擴增實驗室又稱PCR實驗室，室驗室原則上分為4個單獨的工作區域，前兩區為擴增前區，后兩區為擴增后區。擴增前區與擴增后區應嚴格分開。實驗材料、試劑、記錄紙、筆、清潔材料等，只能從擴增前區流向擴增后區，即從試劑準備區→樣品制備區→擴增區→擴增產物產物分析區，不得逆向流動。實驗室的氣體也應從擴增前區流向擴增后區，不得逆向流動。各工作區域應設置緩沖是，工作間與緩沖之間宜安裝連鎖裝置。不同功能的核酸檢驗工作區應是分隔獨立的工作室，并有明顯的標示，各區間不能直通。各區之間如果是緊密相連，需安裝物品傳遞窗。每個工作區域的頂部應安裝紫外燈。紫外燈的波長為 254nm，安裝數量為每20㎡安裝一支40W的紫外燈。PCR實驗室
 實驗室較為理想的布局模式為有一個專用走廊，試劑準備區、樣品制備區、擴增區和產物分析區很規范地排列在一起，前三個區各有一個緩沖間，可供換工作服和工作鞋使用，頂上可裝一紫外燈。內實驗區域設為正壓或常壓狀態，緩沖區內設為負壓狀態（可上設一抽風裝置），使這三個區的空氣流向為由實驗區域內向外，緩沖間內通向內實驗室和走廊和門可安裝一種連鎖裝置，當一個門打開時，另一門必須處于關閉狀態，防止出現兩個門同時打開的情況。產物分析區可不設緩沖間，但應設為負壓狀態（裝一個排風扇即可），使空氣流向由外向內，以防止擴增產物的隨空氣流出。每一區域都必須有明確的標記，工作按試劑準備區、樣品制備區、擴增區至產物分析區單一流向進行，各區的儀器設備包括工作服、鞋、實驗記錄本和筆等都必須專用。如果無法做到以上模式。以下基本要求必須做到：PCR實驗室
（1）四個區域必須是相互獨立的。
（2）各區的儀器設備及各種物品必須是專用的。
（3）各區完全獨立，緩沖間可有可無。如為一個區套一個區的模式，區間不能直通，應有緩沖間，供換工作服及鞋子用，并保證兩個區域間始終處于完全的分隔狀態。
（4）產物分析區應安裝排風扇或其他抽風裝置，維持負壓。PCR實驗室
二、各區功能及主要設
（1）試劑準備區：擴增試劑的配制、分裝和保存。未設緩沖間的試劑儲存和準備區，工作區域為正壓。用于擴增的試劑應冰凍儲存。主要設備―天平、冰箱、離心機、加樣器、振蕩器、紫外燈。
（2）樣品制備區：實驗室樣品的混樣和測試樣品的制備。未設緩沖間時工作區域為負壓或減壓，可安裝排風系統。所用的器具在使用前應經過徹底清洗并消毒，防止交叉污染。主要設備有冰箱、生物安全柜（或潔凈工作臺、排風柜）、離心機、加樣器、振蕩器、恒溫水浴、上下水設備、廢棄物容器、紫外燈。根據制備樣品的性質和要求決定操作臺是選用生物安全柜、潔凈工作臺還是排毒柜，如疾控中心、臨床醫學實驗室—般選用生物安全柜，植物轉基因、檢疫等可選用排毒柜，樣品制備需要較高潔凈條件的選用潔凈工作臺
（3）擴增區：PCR擴增反應體系的配制和模板的加入，核酸擴增。未設緩沖間的擴增區，工作區域為負壓或減壓，可安裝排風系統。加樣應在超凈工作臺（生物安全柜）內進行，超凈工作臺的的氣流方向宜選擇垂流式。核酸擴增設備、冰箱、潔凈工作臺（生物安全柜）、離心機、加樣器、廢棄物容器、紫外燈。
（4）擴增產物分析區：擴增產物的測定。未設緩沖間的擴增產物區，工作區域為負壓或減壓，應安裝排風系統。若實驗僅采用全自動擴增檢測儀（如實時熒光定量PCR儀）可將擴增區與擴增產物分析區合并為一個區。本區所使用的儀器設備有酶標儀、洗板機、加樣器和水浴箱等。
三、實驗室空調通風系統設計及壓力控制
各個區域之間應具備單向的實驗工藝流、物流、人流與與流，形成單向流程的保護屏障，避免實驗之間的相互干擾，防止核配氣溶膠對實驗過程造成污染產生假性結果。
PCR實驗室并沒有嚴格的凈化要求，但是為避免各個實驗區域交叉污染的可能性，宜采用全送全排的氣流組織形式。同時，嚴格控制送、排風的比例以保證各實驗區的壓力要求。
四、實驗室裝修
實驗室的墻體，包括頂棚，應結構牢固、氣密性好；所有陰角宜采用圓弧形線條過渡；墻體內壁光潔、不吸附、耐腐蝕、易清洗消毒；地面材料應滿足無縫隙、無滲漏、光潔、耐腐蝕的要求。地面建議使用PVC卷材地面或自流坪地面，整體性好，便于進行清掃，耐腐蝕。沒有條件的也可采用水磨石地面，或大塊的瓷磚（≥800mm）接縫需要小于2mm。燈具要選用凈化燈具，能達到便于清洗、不積塵的特點。
在三個實驗區和三個緩沖區頂部以及傳送窗內部安裝有紫外燈，供消毒用。在試劑準備區和樣品制備區還設置移動紫外線燈，對實驗桌進行局部消。
試劑和標本通過機械連鎖不銹鋼傳遞窗傳遞，保證試劑和標本在傳遞過程中不受污染。
試劑和樣品通過機械連鎖不銹鋼（不建議使用電子連鎖）傳遞窗傳遞，保證試劑和樣品在傳遞過程中不受污染（人物分流）
五、注意問題
（1）幾個區域的大小設置情況，應該是試劑準備區、產物擴增區、擴增分析區，要小—些。樣品制備區應大—些，因為樣品制備室要放置—個生物安全柜和一個低溫冰箱。
（2)試劑準備區、樣品制備區設立緊急洗眼器，以備不時之需
（3）PCR實驗室的潔凈度可以根據用戶的實際使用情況和資金的投入設計。